Основная научная работа в Исследовательском центре частного права структурирована по отделам, деятельность которых охватывает все сферы частного права. В задачи каждого подразделения входят подготовка научно-исследовательских работ, разработка и экспертиза нормативных правовых актов, участие в научных и просветительских мероприятиях, публикация статей и монографий. Сотрудники научных отделов Центра, как правило, также совмещают свою работу в отделе с преподавательской деятельностью в Российской школе частного права, являются арбитрами третейских судов.
В то же время наиболее значимые вопросы частного права всегда прорабатываются всеми сотрудниками Центра сообща. Давней традицией стало общее обсуждение важных законопроектов и поступающих в Центр запросов на общих заседаниях научных сотрудников и преподавателей Центра.